Poste chercheur Post-Doc (H/F) en écologie microbienne et métabolomique des interactions bactér[...]

Poste chercheur Post-Doc (H/F) en écologie microbienne et métabolomique des interactions bactéries-plantes

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• Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
• Localisation : 69622 VILLEURBANNE (France)
• Nature de l’emploi : Emploi ouvert uniquement aux contractuels
• Nature du contrat : CDD d'1 an
• Rémunération : Fourchette indicative pour les contractuels à partir de 3021€ brut mensuel selon expérience
• Catégorie : Catégorie A (cadre)

Missions :
Le jeune chercheur (H/F) sera intégré(e) au sein de l’équipe Rhizo du laboratoire d’Ecologie Microbienne de Lyon. Il/elle travaillera en étroite collaboration avec C. Prigent-Combaret, DR CNRS, coordinatrice d’un projet innovant ‘SensOrCol’, soutenu par le programme de prématuration du CNRS. Il/elle aura à (i) développer une méthode de criblage haut-débit du comportement de cultivars de colza face à Phelipanche ramosa, et (ii) identifier les mécanismes moléculaires mis en jeu dans l’interaction entre différents cultivars de colza utilisés en France et une bactérie phytobénéfique. Des approches de métabolomique seront utilisées pour identifier le dialogue moléculaire impliqué dans l’interaction bactérie phytobénéfique / colza / P. ramosa.

Activités :
Les principales activités concerneront :

1. Identification des cultivars de colza à inclure dans l’étude et l’obtention de ces cultivars auprès des producteurs de semences de colza.
2. Mise en place de cultures, en parallèle, d’un grand nombre de cultivars de colza en chambre climatique.
3. Criblage haut-débit des interactions colza-bactérie phytobénéfique et comparaison des niveaux de colonisation des colzas par une bactérie phytobénéfique.
4. Analyse ciblée des réponses métabolomiques des colzas à la bactérie phytobénéfique après avoir standardisé une méthode UPLC-QToF sur la plateforme CESN du laboratoire d’Ecologie Microbienne.
5. Traitement statistique des données et présentation des résultats.

Contexte de travail :
Le Laboratoire d'Écologie Microbienne (LEM) du CNRS à Lyon est un centre de recherche internationalement reconnu pour ses travaux à l’interface entre science et innovation, portant sur l'étude des interactions complexes entre les micro-organismes et leur environnement.

Nous vous proposons un contrat de 20 mois pour développer un projet innovant soutenu par le programme de prématuration du CNRS.

Profil recherché :
Compétences :
- Compétences techniques en microbiologie, écologie microbienne et métabolomique.
- Connaissance des interactions plante-bactérie et des stratégies de protection biologique des plantes contre les plantes phytoparasites.
- Aisance pour la rédaction de rapports et d’articles scientifiques.
- Motivation, assiduité, dynamisme et rigueur.
- Curiosité scientifique et créativité.
- Capacité à travailler en autonomie et en collaboration au sein d’une équipe dynamique.
- Fort intérêt pour l’innovation dans le domaine de la protection des plantes.
- Bilingue Anglais-Français.

Niveau d'études minimum requis :
Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents.