Ingénieur-e d’étude en microbiologie et ingénierie génétique

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

ENVIRONNEMENT ET CONTEXTE DE TRAVAIL

Toulouse White Biotechnology (TWB) est une infrastructure de partenaires publics et privés servant de centre d’excellence dans le domaine des biotechnologies industrielles. Ce domaine concerne l’application des biotechnologies à la production industrielle de molécules pour un large éventail d’applications (notamment l’énergie, les produits chimiques, les matériaux, la nutrition, les cosmétiques, les arômes et la santé). Il est basé sur l'utilisation de microorganismes ou de leurs constituants (enzymes) dans des processus industriels. TWB favorise l'émergence d'une nouvelle économie basée sur la transformation du carbone renouvelable et sur une approche de responsabilité sociale des entreprises en développant à l'échelle préindustrielle de nouveaux bioprocédés.

Contexte du poste

Soutenu par un consortium de 46 partenaires (dont 32 industriels), TWB utilise ses plateformes technologiques pour accélérer le développement de produits pour les entreprises privées. En partenariat avec des laboratoires publics de pointe, TWB met à profit son expertise et ses capacités de pointe pour mettre au point des procédés biotechnologiques. Ses activités vont du développement de catalyseurs (enzymes et micro-organismes) à la mise en place de procédés préindustriels. Dans ce contexte, TWB est notamment sollicité pour mener des projets avec des partenaires académiques et des partenaires industriels, centrés sur l’ingénierie génétique et métabolique de différents microorganismes (bactéries, levures, champignons, microalgues…).

VOTRE MISSION ET VOS ACTIVITÉS

L’ingénieur-e d’étude sera impliqué-e dans un projet pluridisciplinaire de quatre ans impliquant différents partenaires et il/elle aura pour mission la réalisation des différentes stratégies d’ingénieries métaboliques dans le but de produire des molécules biosourcées d’intérêt. La personne participera au développement et à la mise en œuvre des stratégies d’ingénierie métabolique et des outils génétiques associés, en collaboration avec les plateformes technologiques de TWB. Elle participera activement à l’évaluation de la robustesse physiologique des souches ainsi qu’à l’évaluation des performances de production des molécules cibles. Elle intégrera une équipe projet multidisciplinaire dédiée et sera en étroite collaboration avec l’équipe bioprocédés. Ainsi, ce projet nécessite une forte expertise en microbiologie, en biologie moléculaire et en ingénierie génétique. Afin de mener à bien ce projet, l’ingénieur-e d’étude devra non seulement maîtriser les aspects techniques mais devra aussi être capable de s'intégrer dans une équipe dynamique et de travailler de façon transversale avec différentes expertises.

Les Activités Principales Seront

• Réaliser l’ingénierie génétique de microorganismes afin d’optimiser la production de molécules d’intérêt.
• Concevoir et optimiser les outils génétiques associés.
• Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques (transformation, clonage, délétion/expression de gènes, expression plasmidique, intégration génomique, PCR, électrophorèse, séquençage, microscopie).
• Cribler des souches selon les besoins du projet (utilisation de sources de carbones spécifiques, synthèse de molécules d'intérêt...), sélection de variants ou mutants par des méthodes de microbiologie, de mutagenèse aléatoire, d'évolution dirigée.
• Assurer le suivi de culture et préparation des échantillons pour différents types d’analyse du contenu cellulaire et extracellulaire.
• Assurer la caractérisation du potentiel de croissance et de production de molécules d'intérêt.
• Mettre en œuvre une démarche qualité et un suivi de la collection de souches et d’outils génétiques générés au cours du projet selon les bonnes pratiques.
• Mettre en forme et analyser avec un œil critique les données issues des expérimentations et en garantir le suivi et la qualité.
• Rédiger des rapports d’expériences ou d’études, des notes techniques.
• Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d’activité.
• Assurer l’application des principes et des règles d’hygiène et de sécurité.

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

M2 dans le domaine biotechnologie, microbiologie, biologie moléculaire, ingénierie métabolique, avec 3 ans d’expérience minimum dans le domaine.

Compétences opérationnelles

Solides connaissances et pratique de l’ingénierie génétique de différents microorganismes, une expérience en levure serait un atout appréciable.

Solides connaissances en microbiologie, biologie moléculaire et génétique.

Solides connaissances en méthodes d’édition du génome (e.g. CRISPR, TALENS, etc.).

Des connaissances sur le développement de méthodes de quantification (e.g. qPCR, RT-qPCR, digital droplet PCR) seront appréciées.

Des connaissances en génomique, transcriptomique ou métabolomiques seraient un atout.

Compétences Comportementales

Autonomie, proactivité, rigueur, adaptabilité, solide éthique professionnelle, esprit d'équipe, aptitudes à la communication, sens de l’organisation.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

• jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
• d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
• de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
• d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
• de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
• d'activités sportives et culturelles ;
• d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation.

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.