Ingénieur de recherche du programme ANDIMBA – CDD 18 Mois

Date de l'annonce : mardi 8 novembre 2022

Intitulé du poste : Ingénieur de recherche du programme ANDIMBA – CDD 18 Mois

Type de structure :
Emploi-type : Ingénieur de recherche
Code unité : Inserm UMR1141 NeuroDiderot (RNSR 200516362T) – équipe InDev (RNSR 201922979Z)
Intitulé : Maladies neurodéveloppementales et neurovasculaires – Imagerie et neurologie du développement du cerveau (Imaging neurodevelopmental phenotypes)
Responsable : Pierre GRESSENS – Lucie HERTZ-PANNIER
Délégation : Régionale DR P7
Date souhaitée de prise de fonctions : Novembre à janvier 2023

Contexte et mission :
BAP : BAP A : « Science de la vie, de la Terre et de l’environnement » / FAP « Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre »

Missions :
Adaptation et mise en œuvre d’outil de neuroanatomie informatisée, traitement et analyse de données IRM anatomiques, dans le cadre du programme ANDIMBA (ANR-19-CE17-0028-01, Spectre de l’Alcoolisation Fœtale : identification de marqueurs neuro-anatomiques en IRM), en collaboration avec l’investigateur principal et les investigateurs associés. La mission comprend la participation aux trois tâches suivantes du programme :

1. Adaptation d’outils de traitement d’images adaptés aux objectifs et données du programme
2. Traitement des images IRM pour obtention des paramètres neuroanatomiques d’intérêt
3. Identification de marqueurs par analyse normative et modélisation prédictive multivarié

Activités principales :

1. Traitement des images IRM (patients, contrôles) pour estimation de paramètres d’intérêt :
   - Application d’un nouvel outil de mesure non supervisée du corps calleux (étude princeps)
   - Adaptation et application de 2 outils de segmentation des hémisphères cérébraux
2. Analyse comparative (patients, contrôles) et intégrative des paramètres neuroanatomiques :
   - Modélisation des effets de taille et/ou de croissance pour analyse normative et identification de paramètres « candidat marqueur »
   - Modélisation multimarqueur (classifieur, prédicteur…) incluant l’ensemble des résultats du projet ANDIMBA sur la base d’outils d’apprentissage informatisé

Activités associées :

1. Contribution à l’étude d’autres paramètres ou structures neuroanatomiques (noyaux gris)
2. Contribution éventuelle à l’encadrement des stagiaires en M2 du programme
3. Contribution à la rédaction et publication d’au moins un article scientifique sur ces travaux

Spécificité(s) / Contrainte(s) du poste :
Site d’exercice : principalement à NeuroSpin (CEA-Saclay, Gif/Yvette), potentiellement à l’INT (Marseille) sous forme de mission, très accessoirement à hôpital Robert-Debré (Inserm U1141 NeuroDiderot, Paris 19e), télétravail selon réglementation de l’Inserm.

Lieu : 48, Bd Serrurier 75019 Paris – NeuroSpin (Bat 145), CEA-Saclay 91191 Gif/Yvette

Rémunération : Selon barème Inserm (contractuel)

Diplômes requis : Ingénieur avec M2 de recherche / Stage M2 ou fin d’étude d’ingénieur en traitement d’images cérébrales humaines ou animales ou biomédicales

Compétences requises : Connaissances :
- Modélisation mathématique et statistique générale (niveau ingénieur)
- Appliquées, en particulier neuroanatomie - neuroimagerie humaine (généralités)
Savoir-faire :
- Programmation langage Python (autonome), environnement Linux (autonome)
- Communication scientifique, y compris illustration (niveau prédoctoral)
- Anglais (niveau CECRL B2-C1)
Aptitudes :
- Aptitude au travail entre plusieurs équipes/interlocuteurs et plusieurs tâches concomitantes
- Bonnes capacités d’autonomie et d’organisation

Contact : Envoyer CV, lettre de motivation et coordonnées, ou bien demande d’informations complémentaires, à David Germanaud, investigateur principal du projet ANDIMBA : david.germanaud@cea.fr et Yann Leprince, ingénieur de recherche statutaire NeuroSpin : yann.leprince@cea.fr