ingénieur d'études (H/F) en bioinformatique

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ingénieur d'études (H/F) en bioinformatique

Date Limite Candidature : mercredi 30 avril 2025 23:59:00 heure de Paris

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Informations générales

Intitulé de l'offre : ingénieur d'études (H/F) en bioinformatique
Référence : UMR5261-JULGON-011
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 08
Date de publication : mercredi 9 avril 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 juin 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : à partir de 2491€ brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+3/4
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données

Missions

Le candidat participera aux projets bioinformatiques développés au sein de l’équipe.
Il devra :

1. analyser et résoudre les problématiques bioinformatiques dans le cadre des programmes de recherche
2. concevoir, développer et déployer des outils bio-informatiques
3. réaliser la gestion et l'analyse des données « omiques »

Activités

Formaliser un problème scientifique en termes techniques.
Assurer la veille technologique dans le domaine et tester de nouvelles approches.
Conseiller pour le choix de méthodologies lors de l'élaboration d'un projet scientifique, et dans leur mise en œuvre.
Développer des outils de traitements automatisés de données biologiques et les appliquer dans le cadre de programme de recherche.
Rédiger des protocoles d’utilisation des outils et des méthodes mises en place.
Créer des bases de données permettant le stockage, la gestion et l'analyse des données produites par les projets d'étude des génomes, transcriptomes…
Assurer le transfert de connaissances et des savoir-faire (animation de réunions bio-informatiques, formations et/ou encadrement des scientifiques (partenaires en accueil, stagiaires et étudiants)).
Apporter une assistance et un support technique en bio-informatique aux membres de l’équipe.

Compétences

Avoir des connaissances en biologie moléculaire et cellulaire et en physiologie du système neuromusculaire.
Avoir des connaissances approfondies dans le domaine de la bio-analyse et la bio-informatique.
Maitriser au moins un langage de programmation parmi Perl, Python, Java, R, PHP et des technologies Web (JQuery, JSON…).
Connaissance des problématiques liées aux Big Data.
Maitriser les systèmes d'exploitation Linux.
Posséder des qualités rédactionnelles et de communication.
Savoir gérer le stockage et la manipulation des données de grande dimension.
Savoir formuler une problématique scientifique en termes techniques.
Maîtriser l’anglais.

Contexte de travail

L'agent sera recruté dans l'équipe "environnement des cellules souches musculaires et homéostasie du muscle strié squelettique" dirigée par Bénédicte Chazaud à l'Institut NeuroMyoGène de Lyon (UCBL1, CNRS5261, INSERM1315). Les travaux de notre équipe visent à comprendre la régulation du tissu musculaire et des types cellulaires (cellules souches, cellules immunes, vaisseaux...) qui le composent dans des contextes physiologiques (e.g., exercice, blessure musculaire) et pathologiques (dystrophies musculaires, cachexie liée au cancer, choc septique...).