Assistant ingénieur en biologie moléculaire (F/H)

À propos de nous

Une université d’excellence

Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).

Une université engagée

Vigilante envers toutes formes de discriminations, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. L’UM place aussi le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.

Structure de rattachement : Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP)

Mission

Intitulé du projet : Rodent Control in the City: health ecology and (re)exposure to rodent-borne infectious agents and vectors

Acronyme du projet : RoCoCity

Durée globale du projet : 3 ans

Description sommaire du projet : Le Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) est composé d’environ 90 agents permanents d’INRAE, de l’IRD, du Cirad et de l’Institut Agro Montpellier. Les recherches qui y sont menées s’inscrivent dans le cadre des impacts liés aux arthropodes phytophages attaquant les cultures et les forêts, aux espèces envahissantes et aux réservoirs de zoonoses, qui pèsent sur la sécurité alimentaire, la biodiversité et la santé. Vous intégrerez l'Axe 3 "Écologie et évolution des zoonoses" qui s'attache à mieux comprendre l’écologie et l’évolution des zoonoses ayant pour réservoirs des petits mammifères sauvages tels que les rongeurs, les musaraignes et les chiroptères. Vous travaillerez avec un collectif de chercheurs et ingénieurs dans le cadre du projet RoCoCity dont l'objectif est d'explorer l'impact potentiel des actions de dératisation sur les dangers zoonotiques liés aux rongeurs dans différents environnements urbains en France et en Afrique (Bénin, Madagascar, Sénégal). Ce projet permettra (i) de décrypter comment les changements (potentiels) induits par la dératisation au sein des communautés de rongeurs réservoirs auront affecté la présence/absence de pathogènes zoonotiques portés localement par ces derniers, et (ii) d'informer (dans une perspective de gestion durable) les services en charge du contrôle des rongeurs des risques zoonotiques liés à ces espèces. Votre travail se déroulera principalement sur le plateau de Biologie Moléculaire commun à l'unité. Ce plateau technique a pour objectif de mutualiser des technologies et compétences en biologie moléculaire au service des programmes de recherche de l’unité. Le plateau compte 11 agents permanents et accueille de nombreux étudiants.

Mission principale : Sous la responsabilité de Gauthier DOBIGNY (CR IRD) et Maxime GALAN (IR INRAE), votre mission consistera à mettre en œuvre des techniques de biologie moléculaire pour (i) étudier la diversité génétique de rongeurs sauvages et commensaux et (ii) caractériser et identifier les cortèges de parasites et pathogènes retrouvés chez ces rongeurs.

Définition des tâches à accomplir : Vos activités seront les suivantes :

1. Mise en œuvre de protocoles pour la réalisation d’un ensemble de techniques de biologie moléculaire : extraction ADN /ADN dégradé, électrophorèse, construction de banques ADN pour séquençage haut-débit (Illumina, Nanopore), génotypage, PCR quantitative.
2. Mise en œuvre de protocoles de biologie moléculaire sur des rongeurs sauvages et leurs pathogènes (bactéries, virus, helminthes).
3. Assurer le conditionnement, la traçabilité des échantillons et la qualité des analyses, incluant l'intégration des données produites dans une base de données.
4. Participer aux tâches transversales liées à la logistique du plateau de biologie moléculaire.
5. Traitement informatique qualitatif et pré-analyse des données produites en séquençage, logiciel de lecture génétique (Galaxy, genemapper, geneious).
6. Rédaction d'un cahier de laboratoire et de rapport de fin d’expérimentation.

Description précise de l'évènement ou du résultat objectif déterminant la fin de la relation contractuelle ainsi que les modalités d'évaluation et de contrôle de ce résultat : Production d’un rapport technique détaillant les méthodologies déployées pour chaque cortège de parasites/pathogènes, les résultats obtenus, et leur validation systématique par la coordination de l'équipe-projet.

Profil

Qualifications / Domaine De Formation Demandé

Diplôme de niveau 5 BTS, BUT ou Licence 3 dans le domaine de la biologie moléculaire, une expérience professionnelle de 2 ans serait un atout.

• Connaissances solides en biologie moléculaire.
• Maitrise des pratiques et connaissances théoriques en biologie moléculaire (extraction et purification d’acides nucléiques, PCR, séquençage, préparation de banques).
• Connaissances des principes des Nouvelles Technologies de Séquençage (plateformes Illumina, nanopore).
• Goût pour la transmission de savoirs et aptitudes pédagogiques.

Rejoindre l'université de Montpellier, c'est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.

Nos Avantages

• Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes.
• 2,5 jours de congés payés par mois (pour un temps plein à 35h00).
• Temps de travail aménageable.
• Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM).
• Restauration collective.
• Aide et prestations sociales.
• Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville.
• Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université.
• Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade.

Informations Complémentaires

Rémunération : de 2050€ à 2230€ brut mensuels, dont 180€ d'indemnité mensuelle des agents contractuels (prime).

Prise de poste : Février

Type de contrat : CDD de catégorie A

Durée du contrat : 15 mois

Clôture des candidatures : 19/01/2025

Fermeture de l'université du 21/12/2024 au 05/01/2025 inclus