Bioanalyste / Bioinformaticien H/F

Le Laboratoire d'Epigénétique et Environnement (LEE), dirigé par le Dr Jorg Tost, au CEA - Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) a pour activité l'analyse de l'épigénome humain dans des populations cellulaires triées de patients atteints de maladies neurodégénératives et de l'effet de différents traitements cliniques sur l'épigénome.

Dans le cadre d'une collaboration étroite avec nos partenaires d'Allemagne, vos missions seront les suivantes :

1. Analyser et intégrer des données provenant de la méthylation de l'ADN à l'échelle du génome, du séquençage de miARN ainsi que de longs ARN non codants dans des échantillons de patients atteints d'atrophie multisystémique (AMS) ou de la maladie de Parkinson ainsi que dans des systèmes cellulaires dans lesquels les changements clés des maladies neurodégénératives sont reproduits.
2. Maintenir et développer les pipelines bioinformatiques pour les modifications analysées.
3. Détecter les ARNs différentiellement exprimés et les changements de méthylation dans de grands ensembles de données et développer des modèles statistiques pour définir les modules moléculaires corégulés altérés.

Vous participerez à la valorisation des résultats du projet par le biais de publications et de présentations.

Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l’inclusion des travailleurs handicapés.

Veuillez envoyer votre CV et une lettre de motivation avec des références à tost@cng.fr

Profil du candidat

Vous avez comme formation un Master et au moins trois ans d'expérience ou doctorat requis en bio-informatique.

Les qualifications attendues sont les suivantes :

1. Bonne connaissance des langages de programmation (Python et/ou Bash) pour l'analyse de données quantitatives à grande échelle.
2. Maîtrise de l'environnement R et de l'utilisation des paquets Bioconductor.
3. Expérience dans la manipulation de données à grande échelle.
4. La maîtrise de l'anglais, en raison de la collaboration internationale, est un prérequis.

Localisation du poste

Fontenay-aux-Roses

Adresse

2 Rue Gaston Crémieux, 91000 Évry

Référence

2024-31401

Description de la Direction

Au sein de la Direction de la Recherche Fondamentale, l'Institut de biologie François Jacob développe des recherches fondamentales, translationnelles et technologiques en radiobiologie et radiotoxicologie ; santé humaine (affections neurodégénératives, infectieuses et immunohématologiques) et génomique médicale et environnementale.

Description de l'unité

L'institut JACOB regroupe plusieurs départements dont le Genoscope et le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) situés à Evry. Ces départements mènent des projets de recherche propres et produisent des données de séquençage à haut débit pour des projets collaboratifs hautement compétitifs. Le CNRGH est le centre national de recherche français qui permet de répondre aux questions scientifiques nécessitant des besoins de séquençage et de génotypage à haut débit grâce au développement et à la mise en œuvre de technologies innovantes et intégrées.