Bio-informaticien single cell et transcriptomique spatiale (H/F)

Portail > Offres > Offre UMR5242-ZAYCHA-005 - Bio-informaticien single cell et transcriptomique spatiale (H/F)

Bio-informaticien single cell et transcriptomique spatiale (H/F)

Date Limite Candidature : lundi 30 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris
Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler

Informations générales

Intitulé de l'offre : Bio-informaticien single cell et transcriptomique spatiale (H/F)
Référence : UMR5242-ZAYCHA-005
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : lundi 9 décembre 2024
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 13 janvier 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : à partir de 2372€ brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+3/4
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données

Missions

1- Combiner des données single cell et spatial transcriptomique pour comparer deux régions neurogéniques du cerveau adulte de souris.
2- Implémentation de méthodes de "deep learning" pour l'analyse de données single cell et imagerie obtenues dans des cerveaux de souris.

Activités

- Adapter les applications informatiques aux besoins du projet.
- Conseiller et former aux techniques et outils développés et rapport des résultats en réunion d'équipe.
- Recherches bibliographiques sur les méthodes de "deep learning" récentes en analyse transcriptomique et d'images.

Compétences

- Experience en analyse bio-informatique de données transcriptomique.
- Curiosité aux concepts biologiques.
- Facilité d'échanger avec biologistes et bio-informaticiens.

Contexte de travail

L'équipe "Logique spatio-temporelle de la neurogénèse adulte" se situe au sein de l'UMR 5242, à l'institut de Génomique fonctionnelle de Lyon (IGFL). C'est un institut pluridisciplinaire, offrant une exposition intéressante à plusieurs modèles systèmes autour de thématiques communes liées au développement, régénération, évolution et physiologie. Notre équipe s’intéresse aux mécanismes cellulaires et moléculaires permettant à des populations de cellules souches neurales distinctes de coordonner leur comportement dans l'espace et dans le temps dans le cerveau adulte.
De plus, nous proposons :
• Un environnement de travail stimulant aux contacts des personnels de la recherche.
• D'excellentes conditions de travail (horaires flexibles, télétravail).
• Un restaurant d'entreprise qui permet de déjeuner à un prix intéressant.
• Un site accessible en transport en commun.