BIO-INFORMATICIEN.NE F/H (DRI2024-48EXT)

UNIVERSELLEMENT HOSPITALIER

Au cœur de la Métropole Nantaise, le CHU de Nantes se positionne, avec près de 13 000 collaborateurs, comme le premier employeur de la région. Appartenir au CHU de Nantes, c’est faire siennes les valeurs du service public hospitalier : égalité, continuité, neutralité et adaptabilité.

ENVIRONNEMENT DU POSTE

Depuis plus de 30 ans le CHU de Nantes conduit une politique très volontariste pour assurer le développement de la recherche biomédicale sur le site. Il compte aujourd’hui parmi les 10 CHU les plus forts chercheurs de France.

Au sein du CHU de Nantes, la Direction de la recherche et de l’innovation (DRI) contribue activement à la mise en œuvre stratégique et opérationnelle de ces enjeux. Elle est organisée en 5 départements : Grands programmes Nationaux & Européens, Innovation & Développement, Investigation & Recherche translationnelle, Promotion, Ressources & Support.

Le département investigation et recherche translationnelle est en charge de la conduite des études, fédérant les 26 unités d'investigation clinique.

MISSIONS

Mission principale : Accompagner les chercheurs de l’équipe ICAGEN (UMR 1307) dans l'analyse bioinformatique des données génomiques et épigénomiques issues des patients atteints de myélome multiple.

• Contribuer à l’intégration des données multiomiques obtenues sur de grandes cohortes de patients.

Finalité : publications et amélioration de la prise en charge de patients atteints de myélome multiple.

• Activités spécifiques :
• Assurer une activité de support auprès des membres de l’équipe en termes d’analyse et d’interprétation de données omiques.
• Mettre en place de pipelines d’automatisation de traitement des données génomiques.
• Assurer une veille scientifique sur le développement de nouveaux outils d’analyse.

PROFIL RECHERCHE

Diplômes souhaités et / ou requis :

• BAC +5 en bioinformatique

Expérience attendue :

• Analyse et intégration de données pan-génomiques.
• Réalisation de pipelines d’automatisation de traitement des données en bulk.
• Connaissance des bases théoriques de l’analyse secondaire des données génomiques.

Compétences et qualités professionnelles :

• Maitrise des langages de programmation : Python, JavaScript, Shell, R.
• Maitrise des outils spécifiques tels que Snakemake, GitHub/GitLab, Conda.
• Capacité à travailler en équipe avec les biologistes, médecins, biomathématiciens et bioinformaticiens.

Pour postuler, envoyer votre CV et lettre de motivation en cliquant sur le bouton "Postuler".

Conditions du poste :

Type d'emploi : Temps plein, CDD

Avantages :

• Flextime
• Prise en charge du transport quotidien
• Réductions tarifaires
• Restaurant d'entreprise
• RTT
• Travail à domicile occasionnel

Horaires :

• Du lundi au vendredi
• Travail en journée

Lieu du poste : Télétravail hybride (44093 Nantes)

Date de début prévue : 02/12/2024