Assistant Ingénieur (H/F) - Développement des intégrations d'outils externes pour l'assistant I[...]

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Assistant Ingénieur (H/F) - Développement des intégrations d'outils externes pour l'assistant IA en métabolomique

Date Limite Candidature : jeudi 10 avril 2025 23:59:00 heure de Paris

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Informations générales

Intitulé de l'offre : Assistant Ingénieur (H/F) - Développement des intégrations d'outils externes pour l'assistant IA en métabolomique
Référence : UMR7272-LOUNOT-004
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : NICE
Date de publication : jeudi 20 mars 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 7 mois
Date d'embauche prévue : 1 mai 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : 2280 et 3335 euros brute mensuel en fonction de l'expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+3/4
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : E - Informatique, Statistiques et Calcul scientifique
Emploi type : Assistant-e en ingénierie logicielle

Missions

L'assistant ingénieur (H/F) contribuera au développement et à l'implémentation des connecteurs permettant à l'assistant IA MetaboLinkAI (https://www.metabolinkai.net) d'interagir avec des outils et bases de données externes essentiels à la recherche en métabolomique. Ces intégrations transformeront l'assistant en un outil complet capable d'exécuter des tâches de bout en bout pour les chercheurs.

Ce poste s'inscrit dans le cadre plus large du projet MetaboLinkAI, mais se concentre sur un module spécifique réalisable en 7 mois. L'assistant ingénieur travaillera sous la supervision directe de l'ingénieur de recherche principal.

Activités

1. Développer des connecteurs API pour l'intégration de l'assistant IA avec des bases de données métabolomiques externes (par exemple, HMDB, MassBank, MetaboLights)
2. Développer des connecteurs API pour des outils d'analyse spectrométrique et les logiciels de traitement de données métabolomiques.
3. Créer et maintenir une documentation technique détaillée des intégrations développées.
4. Mettre en place des procédures de test et de validation pour assurer la fiabilité des connecteurs.
5. Participer aux réunions d'équipe et contribuer à la résolution des problèmes techniques liés aux intégrations.

Compétences

Compétences requises
- Formation: Bac+2/3 en informatique, développement logiciel ou bioinformatique
- Maîtrise du langage Python et des concepts de programmation orientée objet
- Expérience avec les API REST et les protocoles d'échange de données (JSON, XML)
- Connaissance des principes d'intégration de systèmes et d'architecture logicielle
- Expérience souhaitée avec les outils de contrôle de version (Git)
- Connaissance de base en biologie ou chimie appréciée, mais non obligatoire

Compétences relationnelles
- Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire
- Autonomie et organisation
- Communication claire et précise
- Capacité d'apprentissage rapide

Contexte de travail

Le poste est basé à l’Institut de Chimie de Nice, au sein de l’HolobiomicsLab dirigé par le Dr. Louis-Félix Nothias (Equipe D2MS), en étroite collaboration avec le Dr. Fabien Gandon (Wimmics, 3iS, INRIA) et en interactions régulières avec les autres équipes partenaires en France et en Suisse. Si cela est souhaité, le lieu de travail principal pourra être une équipe associée à l’Institut Interdisciplinaire d’Intelligence Artificielle (3IA) à Sophia-Antipolis. Le/la candidat(e) travaillera en étroite collaboration avec des spécialistes en IA et en métabolomique pour développer et tester l’assistant de recherche.

Contraintes et risques

Travail sur des bases de code collaboratives nécessitant une rigueur particulière dans le versionnage.
Adaptation à un environnement de recherche international et collaboratif.
Respect des délais de production scientifique et technique.